古代において射水神社は『延喜式』にも記された官社であり、越中国（富山県の古称）のなかで唯一の名神大社として、その御神威は広く朝野に知れわたり、越中国の大守護神として尊崇されてきました。

奈良時代には、勅命により越中全土の各戸より初穂米奉納の制度が設けられ、国司の補任にあたっては国家安穏・五穀豊穣を祈願する「越中国一宮」として隆盛を極め、戦国期以降も歴代藩主の特別な崇敬を受けました。

明治4年（1871）の近代社格制度によって、射水神社は全国多くの一宮と同様に国幣中社に列格。現鎮座地の高岡城本丸跡には越中四郡（砺波・射水・婦負・新川）の民費で社殿が造営され、同8年9月16日、盛大かつ厳粛に「遷座祭」が斎行されました。

明治33年（1900）、高岡大火により類焼し、社殿樹叢を悉く焼失しましたが、同35年（1902）に官費で再建されましたのが現在の社殿です。

その後、終戦によって官費を断たれた神社の護持は厳しさを極めましたが、神社附属の奉賛組織として「事誠会」や各郡内に事務局を置く「奉斎会」が起ち上げられ、今日の「崇敬奉賛会」に至るまで、広く県内外より崇敬奉賛の赤誠が捧げられています。

特に、昭和50年（1975）には、畏き辺りより幣帛料を賜り、遷座百年祭が麗しく斎行されました。